自理報關企業在開展報關業務前，應向所在地海關申請辦理報關注冊登記手續。取得報關注冊登記證書后，方能在該海關各口岸辦理進出口貨物的報關納稅等事宜。　
(一)申請自理報關注冊登記　
自理報關企業在申請辦理報關注冊登記時，應向海關遞交以下文件資料的正本(或復印件)：　
l.《自理報關注冊登記申請書》；　
2.國務院、外經貿部或省、自治區、直轄市及各地方經貿部門批準文件，或主管部門核發的《外商投資企業批準證書》；　
3.工商行政管理部門核發的《企業法人營業執照》；　
4.企業的合同、章程；　
5.《企業情況登記表》；　
6．《企業管理人員情況表》；　
7．《“h883”企業情況表》；　
8．企業的財會管理制度、賬冊設置情況；　
9.財政部門或其他法律規定的部門出具的驗資報告及開戶銀行賬號；　
l0．法定代表人及其授權的主管報關業務的負責人和報關員的姓名、聯系電話和身份證號碼；　
11．企業印章、報關專用章、企業負責人或主管報關業務的負責人和報關員印章(或簽字)備案文件。　
(二)海關核發《自理報關企業注冊登記證書》　
海關對申請企業所遞交的文件資料進行認真審核，對符合條件的，核發《自理報關企業注冊登記證書》，自理報關企業在獲得該證書后，方可開展報關業務。　
(三)異地海關備案　
自理報關企業，辦理報關注冊登記備案手續，應向所在報關注冊地海關申請并填寫《自理報關企業報關備案申請書》，交驗《自理報關注冊登記證書》、營業執照和批準文件復印件，經海關審核同意后，將上述文件封人關封，交異地海關；經該異地海關審核無異議，則頒發《自理報關企業報關備案證書》，即享有在該關區內務口岸的進出口貨物報關權。