１．高效益
集裝箱運輸經濟效益高主要體現在以下幾方面：
1）簡化包裝，大量節約包裝費用。為避免貨物在運輸途中受到損壞，必須有堅固的包裝，而集裝箱具有堅固、密封的特點，其本身就是一種極好的包裝。使用集裝箱可以簡化包裝，有的甚至無須包裝，實現件雜貨無包裝運輸，可大大節約包裝費用。
2）減少貨損貨差，提高貨運質量。由于集裝箱是一個堅固密封的箱體，集裝箱本身就是一個堅固的包裝。貨物裝箱并鉛封后，途中無須拆箱倒載，一票到底，即使經過長途運輸或多次換裝，不易損壞箱內貨物。集裝箱運輸可減少被盜、潮濕、污損等引起的貨損和貨差，并且由于貨損貨差率的降低，減少了社會財富的浪費，也具有很大的社會效益。
3）減少營運費用，降低運輸成本，由于集裝箱的裝卸基本上不受惡劣氣候的影響，船舶非生產性停泊時間縮短，又由于裝卸效率高，裝卸時間縮短，對船公司而言，可提高航行率，降低船舶運輸成本，對港口而言，可以提高泊位通過能力，從而提高吞吐量，增加收入。
３．高效率
傳統的運輸方式具有裝卸環節多、勞動強度大、裝卸效率低、船舶周轉慢等缺點。而集裝箱運輸完全改變了這種狀況。
1）普通貨船裝卸，一般每小時為35t左右，而集裝箱裝卸，每小時可達400t左右，裝卸效率大幅度提高。同時，由于集裝箱裝卸機械化程度很高，因而每班組所需裝卸工人數很少，平均每個工人的勞動生產率大大提高。
2）由于集裝箱裝卸效率很高，受氣候影響小，船舶在港停留時間大大縮短，因而船舶航次時間縮短，船舶周轉加快，航行率大大提高，船舶生產效率隨之提高，從而，提高了船舶運輸能力，在不增加船舶艘數的情況，可完成更多的運量，增加船公司收入，這樣高效率導致高效益。
３．高投資
集裝箱運輸雖然是一種高效率的運輸方式，但是它同時又是一種資本高度密集的行業。
1）船公司必須對船舶和集裝箱進行巨額投資。根據有關資料表明，集裝箱船每立方英尺的造價約為普通貨船的3.7~4倍。集裝箱的投資相當大，開展集裝箱運輸所需的高額投資，使得船公司的總成本中固定成本占有相當大的比例，高達三分之二以上。
2）集裝箱運輸中的港口的投資也相當大。專用集裝箱泊位的碼頭設施包括碼頭岸線和前沿、貨場、貨運站、維修車間、控制塔、門房，以及集裝箱裝卸機械等，耗資巨大。
3）為開展集裝箱多式聯運，還需有相應的內際設施及內陸貨運站等，為了配套建設，這就需要興建、擴建、改造、更新現有的公路、鐵路、橋梁、涵洞等，這方面的投資更是驚人。可見，沒有足夠的資金開展集裝箱運輸，實現集裝箱化是困難的，必須根據國力量力而行，最后實現集裝箱化。
４．高協作
集裝箱運輸涉及面廣、環節多、影響大，是一個復雜的運輸系統工程。集裝箱運輸系統包括海運、陸運、空運、港口、貨運站以及與集裝箱運輸有關的海關、商檢、船舶代理公司、貨運代理公司等單位和部門。如果互相配合不當，就會影響整個運輸系統功能的發揮，如果某一環節失誤，必將影響全局，甚至導致運輸生產停頓和中斷。因此，要求搞好整個運輸系統各環節、各部門之間的高度協作。
５．多式聯運
由于集裝箱運輸在不同運輸方式之間換裝時，勿需搬運箱內貨物而只需換裝集裝箱，這就提高了換裝作業效率，適于不同運輸方式之間的聯合運輸。在換裝轉運時，海關及有關監管單位只需加封或驗封轉關放行，從而提高了運輸效率。
此外，由于國際集裝箱運輸與多式聯運是一個資金密集、技術密集及管理要求很高的行業，是一個復雜的運輸系統工程，這就要求管理人員、技術人員、業務人員等具有較高的素質，才能勝任工作，才能充分發揮國際集裝箱運輸的優越性。