(一)物流基礎設施與物流發展的不協調
近年來，我國物流業的基礎設施建設一直處于平穩運行狀態，但由于物流需求的快速增長，導致物流供給困難、物流設施短缺。近年來，物流基礎設施現代化程度、機械化程度較低，碼頭、深水泊位、裝卸能力難以滿足當前物流需求。同時，由于運輸效率較低，運輸消耗較大，造成物流成本大幅增加。這些因素直接影響到國際貨物運輸的效率，極大地限制了國際貿易的發展，從而影響到國際物流自身的發展。
(二)非正規物流發展使貿易成本增加
由于我國物流標準與國際物流標準存在一定差異，使得國際貿易難以進行，同時，由于我國物流標準較高、運費較高，國際貿易成本再次上升，阻礙了國際貿易的長期發展。在物流領域內，物流技術和工作標準尚未建立，但與國際標準相比仍有一定差距，物流基礎設施不規范、運營行為仍較多。由于不同地區、不同部門使用的設備不一樣，導致各環節設施不一致，影響到行業的規范化運作。我國貨物運輸效率較低，與世界平均水平相差甚遠。在一定程度上，我國物流的現代化、標準化程度大大降低，物流資源沒有得到有效利用，造成了嚴重的浪費。
(三)相對較低的物流服務對企業競爭力的影響
作為服務行業，物流自身的服務能力和效率將直接影響到物流行業的發展。然而，我國目前的物流水平與效率還處于較低水平。目前我國很多物流企業都還停留在傳統的物流模式，尤其是倉儲、運輸商等方面，距離現代物流運營模式還有一定的差距，這就導致物流服務價值的體現并不明顯，物流的基本功能還沒有完全發揮出來，這就使得許多從事國際貿易的企業無法給予物流企業更多的核心業務。