集裝箱聯運是集裝箱運輸的一種方式，是以集裝箱為運輸單元，將不同的運輸方式有機組合在一起，成為連續的、綜合性的一體化貨物運輸。集裝箱聯運是交通運輸現代化發展的必然產物，是指組織鐵路、水運、公路多種運輸方式進行集裝箱運輸，是通過各種運輸方式主管部門相互配合共同努力而完成運輸的全過程。
集裝箱聯運的出現是單獨靠一種運輸方式開展集裝箱運輸已經不能充分發揮集裝箱運輸的優越性，達不到頂期的效果。因此，組織鐵路、水運、公路多種運輸的集裝箱聯運已成為現代化運輸的必然產物。通過一次托運，一次計費，一份單證，一次保險，由各運輸區段的承運人共同完成貨物的全程運輸。
當今集裝箱聯運已由國內聯運發展到國際聯運，由在一個國家內的不同運輸方式中進行，發展到幾個國家甚至洲際范圍內進行。
中國發展狀況
2012年1至11月，我國集裝箱鐵路水路聯運達183萬標準箱，同比增長4%。交通運輸部副部長徐祖遠​12月15日在此間表示，這一鐵路、水路打破部門分割，聯手打造無縫隙的綜合運輸模式示范項目正加速推進。
2011年5月，交通運輸部和鐵道部聯手啟動了集裝箱鐵水聯運示范項目，當年聯運集裝箱194萬標準箱，今年前11個月，仍同比增長4%。目前，全國鐵路共開行24條集裝箱鐵水聯運快運貨物班列，固定車次和開行時間，自8月起全面網上預訂，服務公開。目前，我國港口集裝箱總量由鐵路水路聯運僅2%，運低于國際上10%至20%的水平。今后，將加速推進集裝箱鐵路水路聯運建設，加大鐵路在集裝箱陸地運輸中的比重，逐步改變中長距離用公路大規模轉運集裝箱的落后狀況，緩解對公路交通的通行壓力。
據交通運輸部統計，今年1至11月，全國港口集裝箱吞吐量超過1.6億標準箱，同比增長8.3%。