物流各功能要素之間普遍存在著“效益背反”現象，如何避免這一不利現象的產生是物流系統管理的重要任務之一。解決該問題的傳統方法是，分析組成物流系統的各個環節， 在各種效益背反、相互矛盾的主要功能要素之間權衡利弊、協調關系，從而尋求最優的物流 作業，或獨立去管理部分環節。而在物流系統變得更大、更復雜時，這種處理辦法往往不再有效。供應鏈物流管理就是采用供應鏈管理思想來實施對物流活動的組織、計劃、協調與控 制，實際上是把企業的所有物流活動作為一個統一的過程來管理。供應鏈物流管理的基本原 則和方法包括五個方面。
(1)整體觀念。供應鏈物流是一個單向、連續的過程，鏈中各環節不是彼此分割的， 而是通過某種聯系（如契約、合同等），在物流、資本、信息等方面形成的一個有效整體。 供應鏈內成員企業不能孤立地優化自身的物流活動，而是通過協作、協調與協同，提高供應 鏈物流的整體效率。
(2)全過程管理。供應鏈物流管理是全過程的戰略管理，它連接供應鏈的各結點企業， 是企業之間相互合作、聯系的紐帶。因此，必須依靠全過程貫通的物流信息，才能保證從總 體上來把握供應鏈物流管理，如果部分信息出現信息的局限或失真，可能導致整體管理的計 劃失真和判斷失誤。
(3)協調利益。從物流角度分析，在供應鏈內部存在不同的利益，不同鏈結上的利益 觀不同。因此，在供應鏈物流管理中，必須通過合理的利益協調和有效分配，形成統一的利 益觀。
(4)全新的管理方法。傳統方法不能完全適應供應鏈中的物流管理，需要采取新的管 理方法。這些方法主要包括以下幾種：
①采用整合的方法來代替企業管理的方法；
②采用總體綜合的方法代替接口的方法；
③采用解除最薄弱鏈的方法尋求總體平衡；
④采用簡化供應鏈的方法來增強信息的有效性，防止信號的堆積放大；
⑤采用經濟控制論的方法實現系統控制。
有效利用社會力量。供應鏈物流管理雖然指明了從企業戰略角度來管理全部供應 鏈，但并不是只能依靠企業內部力量進行運作，也可利用社會力量來執行。例如，利用一個 或者多個第三方物流企業進行物流的運作，而由第四方物流去進行總體的物流資源整合。