物流系統評價的原則主要有：　
1、客觀性原則　
評價的目的是為了決策，因此評價的質量影響著決策的正確性。也就是說，必須保證評價的客觀性，必須弄清評價資料是否全面、可靠、正確，防止評價人員的傾向性，并注意人員的組成應具有代表性。　
2、可比性原則　
替代方案在保證實現系統的基本功能上要有可比性和一致性。個別方案功能突出、內容有新意，也只能說明其相關方面，不能代替其它方面。　
3、系統性原則　
評價指標要包括系統目標所涉及的一切方面，而且對定性問題要有恰當的評價指標，以保證評價不出現片面性。