由于物流質量是衡量物流系統的重要方面，所以發展物流質量的指標體系對于控制和管理物流系統來說至關重要。物流質量指標體系的建立必須以最終目的為中心，是圍繞最終目標發展出來的一定的衡量物流質量的指標。 一般說來，物流服務目標質量指標，包括物流工作質量指標和物流系統質量指標兩個系列。以這兩個指標為綱，在各工作環節和各系統中又可以制定一系列“分目標” 的質量指標，從而形成一個質量指標體系。整個質量指標體系猶如一個樹狀結構，既有橫向的擴展，又有縱向的挖掘。橫向的主干是為了將物流系統的各個方面的工作都包括進去，以免遺漏；縱向的分支是為了將每個工作的質量衡量指標具體化，便于操作。沒有橫向的擴展就不能體現其廣度，沒有縱向的挖掘就不能體現其深度。
1、服務水平指標
滿足顧客的要求需要一定的成本，并且隨著顧客服務達到一定的水平時，再想提高服務水平時，企業往往要付出更大的代價，所以企業出于利潤最大化的考慮，往往只滿足一定的訂單，由此便產生了服務水平指標。可以想見，服務水平越高，企業滿足訂單的次數與總服務次數之比就越高。
2、滿足程度指標
務水平指標衡量的是企業滿足訂單的次數的頻率，但由于每次訂貨數量的不同，所以僅以此來衡量是不完全的，于是就產生了滿足程度指標，即企業能夠滿足的訂貨數量與總的訂單的訂貨數量之比。
3、交貨水平指標
時間的準確性對于物流來說，是衡量其質量的重要方面，因此建立交貨水平指標也很重要。它是指按期交貨次數與總交貨次數的比率。
4、交貨期質量指標
它衡量的是滿足交貨的時間因素的程度，即實際交貨與規定交貨期相差的日數（天）或時數（時）。
5、商品完好率指標
保持商品的完好對于客戶來說是很重要的，即交貨時完好商品量或缺損商品量與總交貨商品量的比率 (%）。寶潔公司在進入中國市場初期，其貨物都是通過鐵路運輸的，由于中國缺乏專業的物流公司，因而其商品完好率很低。也可以用“貨損貨差賠償費率”來衡量商品的破損給公司帶來的損失，對于一個專業的物流公司來說，由于自身的服務水平有限導致商品的破損，要付出一定的賠償金額，這部分金額占同期業務收入總額的比率 (%）即是“貨損貨差賠償費率”。
6、物流噸費用指標
物流噸費用指標即單位物流量的費用（元/噸），這一指標比同行業的平均水平低，說明運送相同噸位貨物費用較低，則此公司擁有更高的物流效率，其物流質量較高。